故 大菅俊明先生は1954年（昭和29年）に東京大学を卒業後、東大附属病院第一内科に入局された。東大の助手を経て、1967年から米国オレゴン州オレゴン霊長類研究所代謝部門に、肝臓の脂質代謝の研究のために留学されている。そこのOscar W. Portman教授は動脈硬化と脂質代謝が専門で、食餌性の動脈硬化を非常に起こしやすいブラジル産のリスザルを使って研究をされていた。大菅先生は1970年に、与えられたテーマであるCholesterol lecithin acyltransferase（LCAT）の肝性起源を証明し得て（1）、帰国の準備をしていた矢先、リスザルにきれいな食餌性のコレステロール胆石が出来ているのを偶然発見したそうである（2, 3）。1968年にSmallが胆汁中のコレステロール飽和度を定量化する基準を示した三角図を発表し、胆石研究は新しいパラダイムに突入していたが、多くの試みにもかかわらず、いまだ霊長類の胆石モデル作成は成功していなかった時代である。
1971年、東大第一内科に帰局したが、1972年にさらに半年間同研究所へ留学するなどして、胆石生成メカニズムの研究を推進された（4-8）。1972年はMayo Clinicから、胆汁酸服用による胆石溶解の第一報が公表され、センセーションを呼んだ年である。帰国の途次、この分野のメッカ、アリゾナのDr. Grundy、ミネソタのDrs. Hofmann、Thistle、Northfield、Simmonds、Danzinger、ボストンのSmall、ニューヨークのDr. Shefer（Mosbachは留守）のところを巡礼し、大変刺激を受けたが、東大第一内科で待っていたのは、鞄一つ置くところのない惨憺たる研究環境だったとのことである。しかしその後、1974年に東大附属病院中央検査部の助手として何とか居場所を見つけることができ、中央検査部の眞重文子さんらと血清胆汁酸の簡易測定法を開発するに至ったと伺っている（9, 10）。
1975年には開学間もない筑波大学へ、臨床医学系（消化器内科）助教授として赴任された。1978年には臨床医学系の教授に昇任され、私が筑波大学の1回生として医学専門学群を卒業して大学院へ進学した1980年当時は、大菅先生の紹介で同じオレゴン霊長類研究所への留学から帰国し、東大第一内科にいらした田中直見先生（後の筑波大学教授）と共に、血清総胆汁酸の簡易測定法を用いて臨床的な仕事を精力的にされていた（11, 12）。
さて、1980年、筑波大学で大菅先生にとって最初の大学院生となった私に、先生は、血清胆汁酸分画の臨床的意義の検討というテーマをくださった。丁度筑波大学消化器内科に赴任されたばかりの井廻道夫先生（後の昭和大学教授）にもご指導いただき、何とか高速液体クロマトグラフィーによる血清胆汁酸分画測定法を確立し、臨床的意義の検討を行うことができた（13-16）。その後大菅先生は、胎児が異常胆汁酸を産生し、肝癌細胞がα胎児蛋白を産生するならば、肝癌細胞も異常胆汁酸を産生して早期診断に役立つかもしれないと考え、筑波大学3回生の正田純一はGC-MSを用いた肝疾患患者の胆汁酸分析を行い、様々な異常胆汁酸を同定した（17-21）。しかし、肝硬変、肝癌に重複して異常胆汁酸が検出され、肝癌の早期発見マーカーの開発という目的には至らなかった。
しばらく筑波大学では胆汁酸分析を中心とした仕事が続いたが、大菅先生は厚生省特定疾患肝内結石症調査研究班の班員として、肝内結石の成因についての検討を我々に指示し、従来の定説とは異なり、一部の肝内結石には細菌感染の果たす役割が少なく、むしろ肝コレステロール代謝の果たす役割のほうが主役であるような石が存在することが明らかになった（22, 23）。大菅先生は当初からリスザルにおける胆石の生成機序と比べながら、やはりヒトのコレステロール胆石の成因を明らかにしたいと考えておられた。コレステロール胆石の生成には肝からのコレステロール過飽和胆汁分泌が必要条件であることから、そのメカニズム解明のために、胆石患者の肝臓でコレステロール合成系と胆汁酸合成系の律速酵素、HMG-CoA reductaseとcholesterol 7α-hydroxylaseの活性を知る必要があると考えていた。両律速酵素はヒトでは活性が低く、従来法では生検組織での正確な測定が困難であったため、1990年以降、筑波大学7回生の本多 彰にGC-MSを使った酵素活性測定法の開発と胆石患者での活性測定（24-27）、9回生の吉田 正には両酵素活性を反映する血清バイオマーカーの開発と臨床応用をテーマとして与えた（28-31）。
大菅教授は1986年から1990年まで附属病院長を務められ、1994年（平成6年）に定年退官された。それ以降、筑波大学での胆汁酸研究は田中直見教授に引き継がれ、それまでに筑波大学で開発された研究手法を応用することにより、胆石の成因に関するさらなる検討が行われた（32-34）。また、大菅教授時代から始まる最大18年間に及ぶ胆石患者の追跡結果をまとめ、たとえ結石の溶解に至らなくとも、UDCA投与の継続は胆石発作の出現頻度を有意に低下させることを示した（35）。
2005年（平成17年）、田中教授の定年退官と共に筑波大学での胆汁酸研究は止まることになった。現在、門下生で胆汁酸関連の研究を継続しているものは、東京医科大学へ移った松﨑靖司、本多彰、池上正だけである（36-46）。正田純一は、筑波大学にてスポーツ医学へ移動し、胆汁酸研究から運動と脂質代謝の研究へとシフトしている。
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